RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ST20Q9HBF5 79 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PI4KAP42356 2102 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.07□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TRAV17A0A0B4J275 112 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM231BA6NCW3 169 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 DPRXA6NFQ7 191 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 K7EP13 123 aa3.06□□□□□ -1.92
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SGCE-211ENST00000522045 CRYGCP07315 174 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TCL1AP56279 114 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PLP1P60201 277 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HBBP68871 147 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MMDQ15546 238 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HES3Q5TGS1 186 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZN92 141 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MOB3BQ86TA1 216 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PDPNQ86YL7 162 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MUC15Q8N387 334 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 NUP35Q8NFH5 326 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR2Z1Q8NG97 314 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR9G1Q8NH87 305 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.06□□□□□ -1.92
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SGCE-211ENST00000522045 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM122AQ96E09 287 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TRGV9Q99603 122 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TXN2Q99757 166 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FZR1Q9UM11 496 aa3.06□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 USF3Q68DE3 2245 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.05□□□□□ -1.92
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SGCE-211ENST00000522045 HSBP1O75506 76 aa3.05□□□□□ -1.92
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SGCE-211ENST00000522045 IGLV2-23P01705 113 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGHV1-46P01743 117 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PPBPP02775 128 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1-16P04430 117 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 OR5AL1P0C617 328 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MGST1P10620 155 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 COL8A2P25067 703 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TFPI2P48307 235 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FABP6P51161 128 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 MFAP2P55001 183 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RBX1P62877 108 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RHOGP84095 191 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TNXAQ16473 311 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 BATFQ16520 125 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 SPRNQ5BIV9 151 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 PATE2Q6UY27 113 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 Q86TA4 180 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ZNF738Q8NE65 137 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 BORCS7Q96B45 105 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FMC1Q96HJ9 113 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 ESPL1Q14674 2120 aa3.05□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 HIGD1CA8MV81 97 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 A8MWL6 223 aa3.04□□□□□ -1.92
SGCE-211ENST00000522045 CORTO00230 105 aa3.04□□□□□ -1.92
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