RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	MRAP2	Q96G30	205 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	OOSP1	A8MZH6	123 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193		H3BUX3	64 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF688	P0C7X2	276 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZPA2	131 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF815P	A8K554	130 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193		M0R1W7	72 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	NUPR1	O60356	82 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	SAA4	P35542	130 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193		K7EM74	188 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGLL1	P15814	213 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	RIPPLY3	P57055	190 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	LAGE3	Q14657	143 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	FXYD5	Q96DB9	178 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2V1	Q13404	147 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	VWC2	Q2TAL6	325 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	RNF182	Q8N6D2	247 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF479	Q96JC4	524 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01587	Q99440	93 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	VCX2	Q9H322	139 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193		G3V318	75 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	OVOL1	O14753	267 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF492	Q9P255	531 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	DKK4	Q9UBT3	224 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	SORL1	Q92673	2214 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	NPS	P0C0P6	89 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		6.44	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PRX2	142 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGLC1	P0CG04	106 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	FCN3	O75636	299 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV2-14	P01704	120 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00311	Q8N616	119 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	PDE6H	Q13956	83 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	MAJIN	Q3KP22	176 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	MORN5	Q5VZ52	161 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	CT83	Q5H943	113 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		6.43	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	ATP6V0E1	O15342	81 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	EMP1	P54849	157 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TDRG1	Q3Y452	100 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	COX11	Q9Y6N1	276 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0U1RRA0	63 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF6B	O95407	300 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	KIR3DS1	Q14943	382 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	SMPX	Q9UHP9	88 aa		6.42	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		6.41	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	GNLY	P22749	145 aa		6.41	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		6.41	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		6.41	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		6.41	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	OVOL3	O00110	214 aa		6.41	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		6.41	□□□□□ -1.38
NEK1-208	ENST00000512193	MSMP	Q1L6U9	139 aa		6.41	□□□□□ -1.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms