RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM9A6NGZ8 99 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLL5B9A064 214 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 M0R3E3 92 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 HBE1P02100 147 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM222AQ5U5X8 452 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 BLNKQ8WV28 456 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV10A0A0B4J240 114 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf94C9JXX5 98 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 AMBPP02760 352 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 GUK1Q16774 197 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 Q5BKY6 102 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 MED28Q9H204 178 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DKK2Q9UBU2 259 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF253O75346 499 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10J4P0C629 311 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RRN3P1Q2M238 152 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 APLNQ9ULZ1 77 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM189A5PLL7 270 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 AZU1P20160 251 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN1BP46527 198 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FXYD5Q96DB9 178 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF503Q96F45 646 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT9Q9Y231 359 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FRAS1Q86XX4 4008 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 J3KRW8 73 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A10P0DMU9 189 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ERCC8Q13216 396 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE6HQ13956 83 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM9Q9Y5J7 89 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNA5P01569 189 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PAXXQ9BUH6 204 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51M1Q9H341 326 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OR7C2O60412 319 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB2AP61019 212 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ICAM4Q14773 271 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS21Q2M5E4 152 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC01587Q99440 93 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 G3V3Q6 166 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 GIPP09681 153 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 HTN1P15515 57 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OXA1LQ15070 435 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 AQP10Q96PS8 301 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 NACAE9PAV3 2078 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HTN3P15516 51 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF141Q8WVD5 230 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 ODF3Q96PU9 254 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF222A6NCQ9 220 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPOP30536 169 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R60P59551 318 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR9Q5T870 116 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 VGLL1Q99990 258 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 LEPP41159 167 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TCTAP57738 103 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DAD1P61803 113 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 BTN1A1Q13410 526 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 KHDC3LQ587J8 217 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8TAT8 98 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PRELID1Q9Y255 219 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 H7BYZ3 331 aa13.24□□□□□ -0.29
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