RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF823P16415 610 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DEPPQ9NTK1 212 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DKK2Q9UBU2 259 aa4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 VPREB1P12018 145 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CFHR1Q03591 330 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TWIST1Q15672 202 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 AICDAQ9GZX7 198 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 BRWD1Q9NSI6 2320 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0G2JRQ6 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SYNJ2BPP57105 145 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ATXN8Q156A1 80 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 A0A096LNJ9 63 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CCL21O00585 134 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PLAUP00749 431 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 FMC1Q96HJ9 113 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 AGRNO00468 2067 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0D9SEW6 157 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 EDDM3BP56851 147 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 Q8NA96 180 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 PAX4O43316 350 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2E1P51965 193 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 METTL26Q96S19 204 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 PRSS38A1L453 326 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 GP9P14770 177 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 CD24P25063 80 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 MPDZO75970 2070 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 TANC2Q9HCD6 1990 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 CD40P25942 277 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 DEFB123Q8N688 67 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 S1PR3Q99500 378 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM243Q9BU79 118 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 M0R1B8 84 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 UPK2O00526 184 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZRM9 215 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZVL8 140 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00596Q86U02 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 CD177Q8N6Q3 437 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 Q96M66 194 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 SDK1Q7Z5N4 2213 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0G2JNJ9 132 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 SPRY3O43610 288 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF137PP52743 207 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 APOC4P55056 127 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 C2orf82Q6UX34 121 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF799Q96GE5 643 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 Q9UFV3 132 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 ERCC8Q13216 396 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 KISS1Q15726 138 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 Q8N7P7 452 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-216ENST00000507116 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms