RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4-59P01825 116 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 MT-ND6P03923 174 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TCL1AP56279 114 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR27Q6MZM9 219 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RASL11AQ6T310 242 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PRNTQ86SH4 94 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 NUP35Q8NFH5 326 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GXF2 115 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM231BA6NCW3 169 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 SNURFLB1AK76 121 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EQM0 130 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CRLF1O75462 422 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CRIP1P50238 77 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TPPP2P59282 170 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6YL49 198 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5R1Q8NH85 324 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 NEU1Q99519 415 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 KLK15Q9H2R5 256 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 GNB4Q9HAV0 340 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MWL6 223 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CHEK1O14757 476 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 SPINK4O60575 86 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV12-3P01733 135 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 P01737 135 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 AMBPP02760 352 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A2P29034 98 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL3P36405 182 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CSN1S1P47710 185 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 Q0VG73 95 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 GTSF1Q8WW33 167 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL26Q96S19 204 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.087e-8■■■□□ 18.2
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM89A2RUT3 159 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFA4O00483 81 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-DQA1P01909 254 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ESDP10768 282 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-DMBP28068 263 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35B1P78383 322 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 DNLZQ5SXM8 178 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 LCN12Q6JVE5 192 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0G2JLM5 398 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 HIGD1CA8MV81 97 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 NUPR1O60356 82 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PF4V1P10720 104 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 FABP4P15090 132 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00310P59036 64 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PYY3Q5JQD4 70 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 TCF24Q7RTU0 167 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 GLMPQ8WWB7 406 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 CR1P17927 2039 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GUS0 222 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 RBAKDNA6NC62 111 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAC2D3DTV9 90 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 CRISP2P16562 243 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMB8P28062 276 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP2-209ENST00000504450 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.25□□□□□ -1.09
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