RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 UMAD1C9J7I0 102 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 CXorf1O96002 111 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 HLA-DRB4P13762 266 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 PDE6HQ13956 83 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ICAM4Q14773 271 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 STOML3Q8TAV4 291 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 CSTL1Q9H114 145 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.88□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GV50 99 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF253O75346 499 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 STAG3L2P0CL84 134 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 STAG3L3P0CL85 134 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 GCHFRP30047 84 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 FXYD7P58549 80 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 SSX7Q7RTT5 188 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF503Q96F45 646 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA25Q9BR10 227 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 RETNQ9HD89 108 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.87□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0J9YX75 114 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 H3BMM0 161 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFB4O95168 129 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 CSN1S1P47710 185 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 FHITP49789 147 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF726P1Q15940 193 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB135Q30KP9 77 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 Q9H3A6 140 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 PRELID1Q9Y255 219 aa9.86□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R3E3 92 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2CO00762 179 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 TENM3Q9P273 2699 aa9.85□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 PRAC2D3DTV9 90 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2G2P60604 165 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 RCHY1Q96PM5 261 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 XCL2Q9UBD3 114 aa9.84□□□□□ -0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 PGPA6NDG6 321 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 OTORQ9NRC9 128 aa9.83□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX46H3BTG2 121 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 SPRY2O43597 315 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB5CP51148 216 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZWC4 215 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 U3KQK5 164 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 AGRNO00468 2067 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 J3KRW8 73 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R2Z0 102 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 IFNA7P01567 189 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 ERCC8Q13216 396 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 CST9LP1Q5W188 147 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 SULT1A2P50226 295 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 GNG5P63218 68 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 A6NJY4 79 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms