RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	ODAM	A1E959	279 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF727	A8MUV8	499 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	GPR31	O00270	319 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	CD14	P08571	375 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	CAPZB	P47756	277 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	SPINT3	P49223	89 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	INSL3	P51460	131 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF137P	P52743	207 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	MSMO1	Q15800	293 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615		Q86TA4	180 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	MALSU1	Q96EH3	234 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	NIN	Q8N4C6	2090 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	MYO7A	Q13402	2215 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	FXYD4	P59646	89 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615		Q6ZQY7	126 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	NEK7	Q8TDX7	302 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CBWD5-231	ENST00000495615	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	IFNA1	P01562	189 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MT-ND6	P03923	174 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	IDO1	P14902	403 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ARF6	P62330	175 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	HBB	P68871	147 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	GINS3	Q9BRX5	216 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	USH2A	O75445	5202 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	IGF2R	P11717	2491 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PTPRD	P23468	1912 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TNC	P24821	2201 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CST7	O76096	145 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	IGHV3-33	P01772	117 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	RTL8B	Q17RB0	113 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	LIMD2	Q9BT23	127 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CST11	Q9H112	138 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ASB4	Q9Y574	426 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NCAPD3	P42695	1498 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	BCL9	O00512	1426 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	C5orf58	C9J3I9	102 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CCL4	P13236	92 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TCTA	P57738	103 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	GNG3	P63215	75 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NEDD8	Q15843	81 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CASC2	Q6XLA1	102 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NUP35	Q8NFH5	326 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	AP3S1	Q92572	193 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	AP1S3	Q96PC3	154 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	OR4C12	Q96R67	309 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CCL19	Q99731	98 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MED11	Q9P086	117 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CD109	Q6YHK3	1445 aa		0.19	□□□□□ -2.38

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