RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 PRSS1P07477 247 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CT45A10P0DMU9 189 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PIP4P1Q86T03 277 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 SAP25Q8TEE9 199 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ZMAT4Q9H898 229 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CCL4P13236 92 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CD69Q07108 199 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 Q86TA4 180 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CD177Q8N6Q3 437 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 Q9H3A6 140 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PRNDQ9UKY0 176 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TCL1BO95988 128 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 C8orf49Q96NF6 230 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFA3O95167 84 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 IGKCP01834 107 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF688P0C7X2 276 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 SRD5A1P18405 259 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MPV17P39210 176 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 LEPP41159 167 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 LOXL3P58215 753 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CT83Q5H943 113 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RAXQ9Y2V3 346 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RND1Q92730 232 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 FBXL15Q9H469 300 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CALYQ9NYX4 217 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PF4V1P10720 104 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TEN1Q86WV5 123 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PROCRQ9UNN8 238 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CD59P13987 128 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE2BQ13066 116 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE2EQ4V326 116 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RASL10AQ92737 203 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 C12orf49Q9H741 205 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CACNA1HO95180 2353 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PRCDQ00LT1 54 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 SPRNQ5BIV9 151 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MDP1Q86V88 176 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 FMC1Q96HJ9 113 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RAX2Q96IS3 184 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ROS1P08922 2347 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CGB1A6NKQ9 187 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 B9A039 149 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TM4SF5O14894 197 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 IFITM1P13164 125 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 WT1-ASQ06250 92 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RIGQ13278 110 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ORMDL3Q8N138 153 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF714Q96N38 554 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 U3KQK5 164 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00694P0DN24 101 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 GP9P14770 177 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 CKS2P33552 79 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 MAGEA5P43359 124 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 FAM201AQ5SY85 155 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 RAB9BQ9NP90 201 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 M0R3E3 92 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 EFNA4P52798 201 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3B-220ENST00000495571 TTC32Q5I0X7 151 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms