RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486812.5

PRDM15-212, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM15, Length 7,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-212ENST00000486812 THBDP07204 575 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TM4SF4P48230 202 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 RHODO00212 210 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 FAM168AQ92567 244 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 INSP01308 110 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 C21orf140B9A014 251 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 CDK2AP2O75956 126 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 RNF152Q8N8N0 203 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 H0YGX0 51 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 MPDZO75970 2070 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 COX7CP15954 63 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 Q6P435 159 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 GLI3P10071 1580 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 LMO1P25800 156 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 COL18A1P39060 1754 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 LGALS9O00182 355 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 Q6ZS92 163 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TM2D2Q9BX73 214 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 UCNP55089 124 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 H3BQ85 93 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 FXYD5Q96DB9 178 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 ITGB4P16144 1822 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 NDUFC1O43677 76 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGKV1-39P01597 117 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGKV1D-39P04432 117 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 MCM3APO60318 1980 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 Q6ZT83 130 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 SERP2Q8N6R1 65 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 BUB3O43684 328 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 CELA2AP08217 269 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 XGP55808 180 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 SEC61GP60059 68 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 DTX1Q86Y01 620 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.29□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 RNF5Q99942 180 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 MYO9BQ13459 2157 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 C20orf197Q8N268 126 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 C1orf159Q96HA4 380 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRR25Q96S07 402 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 RETNQ9HD89 108 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 FHL1Q13642 323 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 NRGNQ92686 78 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 A0A087WWL8 130 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRR20EP86478 221 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRR20CP86479 221 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRR20DP86480 221 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRR20BP86481 221 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRR20AP86496 221 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 MYOD1P15172 320 aa8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.27□□□□□ -1.08
PRDM15-212ENST00000486812 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.2 ms