RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 GAGE13Q4V321 117 aa10.97□□□□□ -0.65
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NISCH-207ENST00000479054 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-207ENST00000479054 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.97□□□□□ -0.65
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NISCH-207ENST00000479054 ZNF134P52741 427 aa10.95□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-207ENST00000479054 PCNX3Q9H6A9 2034 aa10.95□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 PDE6HQ13956 83 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-207ENST00000479054 ZMAT4Q9H898 229 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-207ENST00000479054 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
NISCH-207ENST00000479054 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.93□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.93□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 23
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NISCH-207ENST00000479054 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 NDPQ00604 133 aa10.91□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 NDUFA3O95167 84 aa10.9□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.9□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 A8MWV9 139 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-207ENST00000479054 GUSBP1Q15486 140 aa10.9□□□□□ -0.66
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NISCH-207ENST00000479054 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-207ENST00000479054 TSKUQ8WUA8 353 aa10.9□□□□□ -0.66
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