RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.67□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PRD5 423 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PRF3 423 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PRM7 423 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 VWC2LB2RUY7 222 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 CTSGP08311 255 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 APELAP0DMC3 54 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 ASCL2Q99929 193 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 U3KQK5 164 aa6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 NDUFS8O00217 210 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 EREGO14944 169 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZN92 141 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 FA2HQ7L5A8 372 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 Q8N9W7 124 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 PRR25Q96S07 402 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.65□□□□□ -1.34
ACTB-208ENST00000464611 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.65□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LRRK2Q5S007 2527 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 FAM223BA6NKX1 122 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 F8W735 103 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 H3BUA1 57 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CD33P20138 364 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 TDRG1Q3Y452 100 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ORMDL3Q8N138 153 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SGK494Q96LW2 274 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CCL19Q99731 98 aa6.64□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 OR4C46A6NHA9 309 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZNF785A8K8V0 405 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 H3BTX0 84 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 FOSL1P15407 271 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 TSPOP30536 169 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LMO4P61968 165 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 KLRD1Q13241 179 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LCN12Q6JVE5 192 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CNFNQ9BYD5 112 aa6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ROS1P08922 2347 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PPR1 153 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 OVOL3O00110 214 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 NPFFO15130 113 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 DLEU1O43261 78 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 BUB3O43684 328 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SH2D1AO60880 128 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 CRIP1P50238 77 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 DLX1P56177 255 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ATP5G2Q06055 141 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 C17orf77Q96MU5 243 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 METTL26Q96S19 204 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 FLNCQ14315 2725 aa6.62□□□□□ -1.35
ACTB-208ENST00000464611 PLXNB1O43157 2135 aa6.61□□□□□ -1.35
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