RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ISLRO14498 428 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFB4O95168 129 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 MEOX2P50222 304 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 DEFB1P60022 68 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.24□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GV50 99 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 KNCNA6PVL3 124 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 UMAD1C9J7I0 102 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 CXorf1O96002 111 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 GCHFRP30047 84 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMB3P49720 205 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 SULT1A2P50226 295 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 PSG3Q16557 428 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 GUK1Q16774 197 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 MRAPQ8TCY5 172 aa6.23□□□□□ -1.41
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ANKRD28-208ENST00000463533 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 F6UB75 175 aa6.22□□□□□ -1.41
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ANKRD28-208ENST00000463533 PSG9Q00887 426 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF738Q8NE65 137 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD28-208ENST00000463533 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.22□□□□□ -1.41
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ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
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ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF253O75346 499 aa6.21□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV3-20P01619 116 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 UBE2G2P60604 165 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 CCL20P78556 96 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX261Q6UWH6 196 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.2□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.2□□□□□ -1.42
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ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0J9YX75 114 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 A8MZ25 164 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 H3BMM0 161 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 HLA-DRB4P13762 266 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 ERCC8Q13216 396 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 STHQ8IWL8 128 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 NUDT11Q96G61 164 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 ASCL2Q99929 193 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 OTORQ9NRC9 128 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 PRELID1Q9Y255 219 aa6.19□□□□□ -1.42
ANKRD28-208ENST00000463533 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.19□□□□□ -1.42
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