RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa-0.18□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 G3V2T6 193 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 GPR31O00270 319 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 NDUFC2O95298 119 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 IGHV3-33P01772 117 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 IFNA6P05013 189 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 PDE6GP18545 87 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 FXYD6P3P58550 94 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 ZNF56Q15929 161 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 IFT20Q8IY31 132 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 LINC00269Q8N2A0 174 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 FAM216BQ8N7L0 139 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 LINC00208Q96KT6 92 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 NAT8BQ9UHF3 227 aa-0.19□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 FREM3P0C091 2139 aa-0.2□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 A0A0J9YY99 117 aa-0.2□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 HIST1H2BKO60814 126 aa-0.2□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.2□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 CARD19Q96LW7 228 aa-0.2□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 CST11Q9H112 138 aa-0.2□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 LPAR5Q9H1C0 372 aa-0.2□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-0.2□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 UBR2Q8IWV8 1755 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 RIIAD1A6NNX1 92 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 H7C1C5 153 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 LYRM1O43325 122 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 MT-ND6P03923 174 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 IFNA4P05014 189 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 CSN2P05814 226 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 OGNP20774 298 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 HSD11B1P28845 292 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 CAPZBP47756 277 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 CAV3P56539 151 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 LCN6P62502 163 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 HBBP68871 147 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 REEP5Q00765 189 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 CD109Q6YHK3 1445 aa-0.21□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 SULT1C4O75897 302 aa-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 IFNA14P01570 189 aa-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 PHBP35232 272 aa-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 C1orf140Q5VVS0 124 aa-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 HACD4Q5VWC8 232 aa-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 C10orf111Q8N326 155 aa-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 PYCARDQ9ULZ3 195 aa-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
TTC3-211ENST00000460328 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 SPTBP11277 2137 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 PRORSD1PA6NEY8 169 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 MFSD11O43934 449 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 CST7O76096 145 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 ATG12O94817 140 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 FADDQ13158 208 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 LTC4SQ16873 150 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 XAF1Q6GPH4 301 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 ANGPTL5Q86XS5 388 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 CEP19Q96LK0 163 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 OR4C12Q96R67 309 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 OTORQ9NRC9 128 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 SSR3Q9UNL2 185 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 DSPPQ9NZW4 1301 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-0.23□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 TRAV5A0A0B4J249 113 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 IGHV3-30P01768 117 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 GLRXP35754 106 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 PPP1R2P41236 205 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 FXYD3Q14802 87 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 C10orf99Q6UWK7 81 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 ARL17AQ8IVW1 177 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 PBDC1Q9BVG4 233 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 PROK2Q9HC23 129 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.24□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 FXYD1O00168 92 aa-0.25□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 AIPO00170 330 aa-0.25□□□□□ -2.45
TTC3-211ENST00000460328 FABP4P15090 132 aa-0.25□□□□□ -2.45
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