RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.78□□□□□ -1.32
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LMO3-210ENST00000453727 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.78□□□□□ -1.32
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LMO3-210ENST00000453727 TCF19Q9Y242 345 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 NOTCH2Q04721 2471 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 TIMM23O14925 209 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-210ENST00000453727 BRI3O95415 125 aa6.74□□□□□ -1.33
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