RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 J3KRW8 73 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 L7N2F9 121 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 IL7P13232 177 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 VAMP2P63027 116 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 OR5I1Q13606 314 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF846Q147U1 533 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CST7O76096 145 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLC2P0DOY2 106 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CAMLGP49069 296 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 BCAP31P51572 246 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CAV2P51636 162 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB31Q13636 194 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CLINT1Q14677 625 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 MIC13Q5XKP0 118 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SSX7Q7RTT5 188 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C6orf223Q8N319 242 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE12BA1L429 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C16orf90A8MZG2 172 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G10O15496 165 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE7O76087 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE12FP0CL80 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE12GP0CL81 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE12IP0CL82 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CT45A10P0DMU9 189 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 HOXA5P20719 270 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZRG5 221 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0J9YY99 117 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C5orf51A6NDU8 294 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 LYRM1O43325 122 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 M6PRP20645 277 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 LEPP41159 167 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 IGSF23A1L1A6 192 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SNURFLB1AK76 121 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 RLN2P04090 185 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TCRBP04435 133 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 S100A10P60903 97 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 BAXQ07812 192 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 GUK1Q16774 197 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZTI0 123 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf50Q96LR7 162 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 Q9H8V8 135 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT15Q9NV35 164 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 M0R3E3 92 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 SULT1A1P50225 295 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ERCC8Q13216 396 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 VWC2Q2TAL6 325 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF503Q96F45 646 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ODF3Q96PU9 254 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PFDN5Q99471 154 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF253O75346 499 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 FGF7P21781 194 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 S100A11P31949 105 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 ESRGQ1W209 222 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE2CQ5TA81 110 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 STX12Q86Y82 276 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SH3BP4-206ENST00000446904 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms