RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 H3BRN7 92 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN4O14817 238 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 IGHG2P01859 326 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 UBE2G2P60604 165 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 LYZP61626 148 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 TIGITQ495A1 244 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 Q56UQ5 140 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 CST9LP1Q5W188 147 aa5.03□□□□□ -1.6
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CCL20-202ENST00000409189 PIFOQ8TCI5 191 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 PAXXQ9BUH6 204 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 TM2D2Q9BX73 214 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.03□□□□□ -1.6
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CCL20-202ENST00000409189 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-202ENST00000409189 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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CCL20-202ENST00000409189 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.02□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 RD3LP0DJH9 198 aa5.02□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 C15orf32Q32M92 178 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.02□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 TMEM219Q86XT9 240 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 FXYD5Q96DB9 178 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.02□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.01□□□□□ -1.61
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CCL20-202ENST00000409189 TAS2R60P59551 318 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 LY6EQ16553 131 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 DEFB112Q30KQ8 113 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 RNF212Q495C1 297 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 ZNF343Q6P1L6 599 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 ZNF329Q86UD4 541 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-202ENST00000409189 TMEM86BQ8N661 226 aa5□□□□□ -1.61
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