RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF503Q96F45 646 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 DUX5Q96PT3 197 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IGKV1-17P01599 117 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IGLV1-47P01700 117 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 HLA-DMBP28068 263 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ASIPP42127 132 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 UBE2E1P51965 193 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 PRSS46E5RG02 174 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 H3BRN7 92 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ADAMTS20P59510 1910 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 HBDP02042 147 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 FOSL1P15407 271 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 K7EIM0 57 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF56Q15929 161 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 HAX1O00165 279 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 DNLZQ5SXM8 178 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF492Q9P255 531 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 Q1RN00 199 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 PET117Q6UWS5 81 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 YPEL4Q96NS1 127 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SPEGQ15772 3267 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 I3L2K1 104 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 GP9P14770 177 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 TDRG1Q3Y452 100 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 Q8N7P7 452 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 GAGE10A6NGK3 116 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 TEX22C9J3V5 150 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 TSPOP30536 169 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 PDE6HQ13956 83 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 VGLL1Q99990 258 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 CD7P09564 240 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 EYSQ5T1H1 3165 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 HERVK_113P61574 105 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 MAJINQ3KP22 176 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SMIM12Q96EX1 92 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 OVOL3O00110 214 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 NDUFA3O95167 84 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 LTAP01374 205 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 PRR25Q96S07 402 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF688P0C7X2 276 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 CT83Q5H943 113 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 HIST1H4GQ99525 98 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 SYT8Q8NBV8 401 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 PSMG4Q5JS54 123 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-206ENST00000368215 B4DSR2 109 aa6.65□□□□□ -1.34
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