RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 GOSR1O95249 250 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 RHOGP84095 191 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ASCL2Q99929 193 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 BPESC1Q9GZL8 116 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ATP6V0E1O15342 81 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 LY6DQ14210 128 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 ECSCRQ19T08 205 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 TPPP3Q9BW30 176 aa15.21■□□□□ 0.03
SPNS1-201ENST00000311008 IGF2RP11717 2491 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 NPFFO15130 113 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 GPR183P32249 361 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PET117Q6UWS5 81 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM191AQ9H0A3 160 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PRORYQ9H606 182 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 OR4C46A6NHA9 309 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 BATFQ16520 125 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 AP5S1Q9NUS5 200 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 LRBAP50851 2863 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC3BP05452 202 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 IGLL1P15814 213 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 TSPOP30536 169 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 ST20Q9HBF5 79 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 BUB3O43684 328 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 MAJINQ3KP22 176 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 FA2HQ7L5A8 372 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 ATP6V0BQ99437 205 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 SLC50A1Q9BRV3 221 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 RBAKDNA6NC62 111 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 U3KQK5 164 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 IGHG4P01861 327 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 FAM104BQ5XKR9 115 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA12Q7Z6I5 190 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 CSN3P07498 182 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF138P52744 262 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 VGLL1Q99990 258 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 G0S2P27469 103 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 OR10AG1Q8NH19 301 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 HSBP1L1C9JCN9 74 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00173Q6ZV60 143 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 ORMDL3Q8N138 153 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 C5orf56Q8N8D9 126 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 NBASA2RRP1 2371 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC140Q96MF4 163 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC19AQ6UXS0 136 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 TACC2O95359 2948 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 DLEU1O43261 78 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 IGLC6P0CF74 106 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 Q8TAT8 98 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 METTL26Q96S19 204 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM213A2RRL7 107 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 D6R8Y8 96 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 PAX8Q06710 450 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 PRELID3AQ96N28 172 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 MOB4Q9Y3A3 225 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 G3V318 75 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 HLA-DMBP28068 263 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 MS4A6AQ9H2W1 248 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 ATRXP46100 2492 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 CLPSL1A2RUU4 121 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 C19orf84I3L1E1 186 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 ATP5G2Q06055 141 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 LINC01545Q5VT33 79 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 IGFL4Q6B9Z1 124 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF747Q9BV97 191 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 FAM223BA6NKX1 122 aa15.11■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 FAM223AQ8IWN6 122 aa15.11■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 AMN1Q8IY45 258 aa15.11■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 CNFNQ9BYD5 112 aa15.11■□□□□ 0.01
SPNS1-201ENST00000311008 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms