RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKCP01834 107 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.73□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf172C9J069 976 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 H7C2G1 150 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 IL4P05112 153 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNTFRP26992 372 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSMPQ1L6U9 139 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 CT83Q5H943 113 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 OTORQ9NRC9 128 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF492Q9P255 531 aa11.72□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLL5B9A064 214 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3-23P01764 117 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 COX7A1P24310 79 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPEQ96AT9 228 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR33A8MZF0 331 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.71□□□□□ -0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A096LNJ9 63 aa11.71□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.71□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.71□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.71□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTPRBP23467 1997 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAS8-AS1O95177 125 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 C3orf36Q3SXR2 165 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRAP2Q96G30 205 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf106Q8NAJ2 232 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PROCRQ9UNN8 238 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 CREBBPQ92793 2442 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 F8W1H4 67 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 C12orf74Q32Q52 190 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEND1Q8N111 149 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBXL15Q9H469 300 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.7□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGFBPL1Q8WX77 278 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 GP9P14770 177 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC6Q6W4X9 2439 aa11.69□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 DPM2O94777 84 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 MT-ATP8P03928 68 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 NGBQ9NPG2 151 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 B5MCH6 92 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SH2D1AO60880 128 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SVIPQ8NHG7 77 aa11.68□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 LAMTOR5O43504 91 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 GATA3P23771 443 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRRG2O14669 202 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYCNOSP40205 109 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 HES1Q14469 280 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCGB2A1O75556 95 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV3-15P01624 115 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF183Q96D59 192 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.67□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRIP1P50238 77 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 EFNA4P52798 201 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRTN3P24158 256 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIVA1O15304 175 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.66□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD40P25942 277 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 POU2AF1Q16633 256 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAFA1Q96PS6 74 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR11H12B2RN74 326 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRY2O43597 315 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 EMP1P54849 157 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR11H1Q8NG94 326 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR11H2Q8NH07 326 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01549A6NIU2 74 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCGB1A1P11684 91 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms