RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ESDP10768 282 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 JPT2Q9H910 190 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-201ENST00000261266 THADAQ6YHU6 1953 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 CD24P25063 80 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 HERVK_113P63121 156 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 CITED1Q99966 193 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-39P01597 117 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1D-39P04432 117 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 VOPP1Q96AW1 172 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ADCYAP1P18509 176 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 CST9LQ9H4G1 147 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 HLA-DRB4P13762 266 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 HTN3P15516 51 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2V1Q13404 147 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 FXYD5Q96DB9 178 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 DLEU1O43261 78 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 CDK2AP2O75956 126 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 IGLC1P0CG04 106 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 OVOL3O00110 214 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 GAGE2EQ4V326 116 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 PCP4P48539 62 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 PRSS33Q8NF86 280 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM243Q9BU79 118 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 NCR2O95944 276 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 PRSS47A8MTI9 375 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 RNF144BQ7Z419 303 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 TET1Q8NFU7 2136 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 HERV-K104P63124 156 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C2orf82Q6UX34 121 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 MYO7AQ13402 2215 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF726P1Q15940 193 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 VWC2LB2RUY7 222 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 PAX4O43316 350 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 SNAI2O43623 268 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 KIR3DS1Q14943 382 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB131AP59861 70 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 SCN2AQ99250 2005 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 K7EMT4 169 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 COX8AP10176 69 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 F8W1H4 67 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 AZU1P20160 251 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 SYNJ2BPP57105 145 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 GAGE2BQ13066 116 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 DAD1P61803 113 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZVH6 145 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 Q8TAT8 98 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 NDPQ00604 133 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 GAGE1Q13065 139 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 CR1LQ2VPA4 569 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 COX11Q9Y6N1 276 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 A0A087X0K7 114 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C9orf118A6NHY6 69 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 WT1-ASQ06250 92 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 EREGO14944 169 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C8orf49Q96NF6 230 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 NINQ8N4C6 2090 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 Q96MF0 132 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms