RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.79□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.79□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.79□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.79□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.79□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.79□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 A0A0G2JRQ6 117 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 hDV102S1A0JD36 115 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 C9orf118A6NHY6 69 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 SIVA1O15304 175 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 UBL5Q9BZL1 73 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 A0A087WWL8 130 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 C5orf63A6NC05 138 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 PAX9P55771 341 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 C8orf49Q96NF6 230 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 NPC2P61916 151 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 FOXE3Q13461 319 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 ZNF114Q8NC26 417 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 RHOHQ15669 191 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 Q96MF0 132 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.78□□□□□ -1.48
CPS1-201ENST00000233072 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 C9JAW5 83 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 RNF223E7ERA6 249 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 C15orf65H3BRN8 121 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 K7EP34 96 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 IGKV1-16P04430 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 LOXP28300 417 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 MPV17L2Q567V2 206 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 C11orf52Q96A22 123 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 MESP1Q9BRJ9 268 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 U3KQA8 63 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 HLA-DRB4P13762 266 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 TMEM126AQ9H061 195 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.77□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 IGLV3-1P01715 115 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 IGHG4P01861 327 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 A0A087X0K7 114 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 GAGE12JA6NER3 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 A8MWP6 167 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 GAGE7O76087 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 GAGE12FP0CL80 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 GAGE12GP0CL81 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 GAGE12IP0CL82 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 GAGE4Q13068 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 PRR25Q96S07 402 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 J3QKU1 62 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 LTAP01374 205 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 ACYP1P07311 99 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 NBL1P41271 181 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 A0A0U1RRA0 63 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 SMKR1H3BMG3 65 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 DKK1O94907 266 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 GAGE5Q13069 117 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 VWC2Q2TAL6 325 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZRM9 215 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 V9GYV3 84 aa5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 F5H768 121 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 PROK2Q9HC23 129 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 GAGE6Q13070 117 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 DEFB130BP0DP73 79 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 DEFB130AP0DP74 79 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 HERV-K104P63124 156 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 COL4A6Q14031 1691 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 PYY3Q5JQD4 70 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZR03 302 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 VOPP1Q96AW1 172 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 ZMAT4Q9H898 229 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.75□□□□□ -1.49
CPS1-201ENST00000233072 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms