RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 OR10G8Q8NGN5 311 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 DPF1Q92782 380 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 C16orf92Q96LL3 132 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 GPHB5Q86YW7 130 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 OR1L6Q8NGR2 347 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FAM210BQ96KR6 192 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM68Q96MH6 324 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 CHEK1O14757 476 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 CRIP1P50238 77 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 PLP1P60201 277 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 LCN12Q6JVE5 192 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 NUDT10Q8NFP7 164 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 NUDT11Q96G61 164 aa5□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 M0QZK8 103 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 CD5LO43866 347 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 MYCNOSP40205 109 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 CFHR3Q02985 330 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 NAGKQ9UJ70 344 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 IGLV2-11P01706 119 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 CD99P14209 185 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 RHEBQ15382 184 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 RELQ04864 619 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TENM2Q9NT68 2774 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM213A2RRL7 107 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 F2Z2F3 143 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 NDUFA6P56556 154 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 PSG8Q9UQ74 426 aa4.99□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 GCGP01275 180 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FOXE3Q13461 319 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ATG101Q9BSB4 218 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF738Q8NE65 137 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 V9GYV3 84 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 DIRC3C9JPN6 131 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 M0QZ24 198 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FABP1P07148 127 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.98□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0G2JLM5 398 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FOLR2P14207 255 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 PSMG4Q5JS54 123 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FAM223BA6NKX1 122 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 HIGD1CA8MV81 97 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 M0R2Z0 102 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TRGC1P0CF51 173 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 KRTAP10-3P60369 221 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 PRR9Q5T870 116 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 C11orf52Q96A22 123 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 GPR82Q96P67 336 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ANK2Q01484 3957 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 GTSF1Q8WW33 167 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 YPEL4Q96NS1 127 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 NEU1Q99519 415 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ORM1P02763 201 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 Q86TA4 180 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.97□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.96□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 FAM106AQ4KMX7 169 aa4.96□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 USMG5Q96IX5 58 aa4.96□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 RNF114Q9Y508 228 aa4.96□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.96□□□□□ -1.61
CNIH1-201ENST00000216416 KNCNA6PVL3 124 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms