RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	TRGC2	P03986	189 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	CXCL1	P09341	107 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	NUP35	Q8NFH5	326 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	OR4K15	Q8NH41	348 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	CEP19	Q96LK0	163 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		0.36	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	FREM3	P0C091	2139 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175		K7EIL1	84 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	TMBIM6	P55061	237 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF714	Q96N38	554 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	GINS3	Q9BRX5	216 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	SSR3	Q9UNL2	185 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	TET1	Q8NFU7	2136 aa		0.35	□□□□□ -2.35
ATRX-223	ENST00000637175	hDV103S1	A0JD37	113 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	MFSD11	O43934	449 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	IFNA1	P01562	189 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	IFNA14	P01570	189 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	KLRD1	Q13241	179 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	NCAPD3	P42695	1498 aa		0.34	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175		A0A0D9SG42	100 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PHGR1	C9JFL3	82 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175		K7ERJ3	54 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PPY	P01298	95 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	APOA2	P02652	100 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	IFNA4	P05014	189 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	VBP1	P61758	197 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	SNCB	Q16143	134 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA45	Q537H7	98 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	MALSU1	Q96EH3	234 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		0.33	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	CD109	Q6YHK3	1445 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	ODAM	A1E959	279 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	C9orf170	A2RU37	121 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	RER1	O15258	196 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	HIST1H2BK	O60814	126 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	IGHV3-33	P01772	117 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	CSN2	P05814	226 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	MSMO1	Q15800	293 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	SPINK9	Q5DT21	86 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	LYG2	Q86SG7	212 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC18	Q8N456	261 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PIAS1	O75925	651 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	PRH1	P02810	166 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	IDO1	P14902	403 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	GNG3	P63215	75 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	HBB	P68871	147 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	POU6F1	Q14863	301 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	IFT20	Q8IY31	132 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	ATOH7	Q8N100	152 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	AP3S1	Q92572	193 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	CARD19	Q96LW7	228 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		0.31	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	BCL9	O00512	1426 aa		0.3	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	LYRM1	O43325	122 aa		0.3	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	CD14	P08571	375 aa		0.3	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	LTC4S	Q16873	150 aa		0.3	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		0.3	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		0.3	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		0.3	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		0.3	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	APC	P25054	2843 aa		0.29	□□□□□ -2.36
ATRX-223	ENST00000637175	MUC4	Q99102	2169 aa		0.29	□□□□□ -2.36

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