RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ITPR1	Q14643	2758 aa		10.3	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		M0R2Z0	102 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	OR2J3	O76001	311 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	NHLH1	Q02575	133 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	TPPP3	Q9BW30	176 aa		10.29	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM11	P17152	192 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	MFAP4	P55083	255 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	RBX1	P62877	108 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFB8	O95169	186 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA45	Q537H7	98 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		10.28	□□□□□ -0.76
BRF1-222	ENST00000635152		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CHEK1	O14757	476 aa		10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	PSG8	Q9UQ74	426 aa		10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	SPG11	Q96JI7	2443 aa		10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CT83	Q5H943	113 aa		10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.27	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152		M0QZK8	103 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF138	P52744	262 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf49	Q96NF6	230 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		10.26	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152		K7EQM0	130 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	PSG3	Q16557	428 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CRIP1	P50238	77 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		10.25	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CSN3	P07498	182 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	THYN1	Q9P016	225 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	RNF24	Q9Y225	148 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	UQCRFS1	P47985	274 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZVH6	145 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152		Q8N6K4	173 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		10.24	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CTSG	P08311	255 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CTRL	P40313	264 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	C1RL	Q9NZP8	487 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152		Q8N9W7	124 aa		10.23	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GUT8	65 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	FAM106CP	P0CH98	169 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	GPR183	P32249	361 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	SAA4	P35542	130 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	TXN2	Q99757	166 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
BRF1-222	ENST00000635152	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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