RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 MED12Q93074 2177 aa16.27■□□□□ 0.2
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CTDP1-208ENST00000613122 OR2K2Q8NGT1 345 aa16.27■□□□□ 0.19
CTDP1-208ENST00000613122 CYTL1Q9NRR1 136 aa16.27■□□□□ 0.19
CTDP1-208ENST00000613122 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa16.27■□□□□ 0.19
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.27■□□□□ 0.19
CTDP1-208ENST00000613122 RASL11AQ6T310 242 aa16.27■□□□□ 0.19
CTDP1-208ENST00000613122 SFTA2Q6UW10 78 aa16.27■□□□□ 0.19
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHB2Q96CS7 222 aa16.26■□□□□ 0.19
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM238C9JI98 176 aa16.26■□□□□ 0.19
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CTDP1-208ENST00000613122 GGTLC3B5MD39 225 aa16.26■□□□□ 0.19
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CTDP1-208ENST00000613122 H3BUT2 72 aa16.24■□□□□ 0.19
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CTDP1-208ENST00000613122 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.23■□□□□ 0.19
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CTDP1-208ENST00000613122 NUP35Q8NFH5 326 aa16.23■□□□□ 0.19
CTDP1-208ENST00000613122 MS4A6AQ9H2W1 248 aa16.23■□□□□ 0.19
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CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZRM9 215 aa16.22■□□□□ 0.19
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CTDP1-208ENST00000613122 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa16.22■□□□□ 0.19
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CTDP1-208ENST00000613122 HIST1H2BKO60814 126 aa16.2■□□□□ 0.18
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CTDP1-208ENST00000613122 HIST1H2BOP23527 126 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 HIST1H2BBP33778 126 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 HIST1H2BDP58876 126 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 HIST1H2BCP62807 126 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 HIST2H2BEQ16778 126 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
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CTDP1-208ENST00000613122 HIST1H2BNQ99877 126 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 HIST1H2BMQ99879 126 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GV90 55 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 WDR86Q86TI4 376 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 ERG28Q9UKR5 140 aa16.2■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa16.19■□□□□ 0.18
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CTDP1-208ENST00000613122 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa16.19■□□□□ 0.18
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CTDP1-208ENST00000613122 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.19■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf194Q5T5A4 169 aa16.19■□□□□ 0.18
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CTDP1-208ENST00000613122 GAGE4Q13068 117 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 GAGE5Q13069 117 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 GAGE13Q4V321 117 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 ORAOV1Q8WV07 137 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 ELANEP08246 267 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM75Q8N9X5 138 aa16.18■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 ATXN8Q156A1 80 aa16.17■□□□□ 0.18
CTDP1-208ENST00000613122 ABCA4P78363 2273 aa16.17■□□□□ 0.18
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