RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RPP30P78346 268 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SPANXN5Q5MJ07 72 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZNX1 250 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01587Q99440 93 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NRARPQ7Z6K4 114 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A7P31151 101 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R60P59551 318 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8A1Q8NGG7 326 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 HTN1P15515 57 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOBP62745 196 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SSX7Q7RTT5 188 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM256Q8N2U0 113 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf74Q96GX8 76 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL7P18124 248 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL3P19876 107 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM144Q7Z5S9 345 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA12Q7Z6I5 190 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 HIGD1AQ9Y241 93 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 IL5P05113 134 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB5P09067 269 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 BTCP35070 178 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 RAP2BP61225 183 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R1AQ13522 171 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CLINT1Q14677 625 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8N1X5 172 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 UHRF2Q96PU4 802 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH5Q8TE73 4624 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SMCO3A2RU48 225 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SFT2D2O95562 160 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087X0K7 114 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 HYPMO75409 117 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00869P0C866 280 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG3Q16557 428 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 Q9H8V8 135 aa17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5G3P0C626 314 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PLP1P60201 277 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN1BP46527 198 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PMS2P5A8MQ11 134 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR3DS1Q14943 382 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF493Q6ZR52 646 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MARVELD1Q9BSK0 173 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SCRT2Q9NQ03 307 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNKO75909 580 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBP04435 133 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP10-2P60368 255 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ID3Q02535 119 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5I1Q13606 314 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC20Q8TCA0 184 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PATE2Q6UY27 113 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00612Q8N6U2 182 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10J6PQ8NGY7 276 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 Q9H3A6 140 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PSENENQ9NZ42 101 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0J9YY99 117 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GVG6 124 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 H7BYZ3 331 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAP1O75689 374 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFB6O95139 128 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOTP62341 195 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC32Q5I0X7 151 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 RXFP4Q8TDU9 374 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL6Q9H0F7 186 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 M6PRP20645 277 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA5P20719 270 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf85Q9H1P6 137 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ESRGQ1W209 222 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF503Q96F45 646 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 UPK3BQ9BT76 320 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ARV1Q9H2C2 271 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT15Q9NV35 164 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SSSCA1O60232 199 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 H2AFB2P0C5Z0 115 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 DLK1P80370 383 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A11Q08AI6 406 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 GFI1BQ5VTD9 330 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf144Q9BQM9 153 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-211ENST00000590874 GAGE12BA1L429 117 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms