RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRTN3	P24158	256 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CSN1S1	P47710	185 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	MFAP4	P55083	255 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	GNG5	P63218	68 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSG9	Q00887	426 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLA	Q13239	276 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q86TA4	180 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1RL	Q9NZP8	487 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516		H3BRN7	92 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	C3orf79	P0CE67	100 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	NTF3	P20783	257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDKN1A	P38936	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CAMP	P49913	170 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDSN	Q15517	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPATA45	Q537H7	98 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516		F2Z2F3	143 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	TIMM23	O14925	209 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	EREG	O14944	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNTFR	P26992	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	NIT1	Q86X76	327 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	TXN2	Q99757	166 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	GNG7	O60262	68 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	FOXC2	Q99958	501 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516		A0A1B0GUT8	65 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516		K7EIM0	57 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	HLA-DRB1	P01911	266 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CTRL	P40313	264 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	RAB9A	P51151	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	GAGE1	Q13065	139 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	NRGN	Q92686	78 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	FOSL1	P15407	271 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q8N976	141 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	CFHR4	Q92496	578 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	HES1	Q14469	280 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSG3	Q16557	428 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NEDD4L-223	ENST00000588516	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	IL4	P05112	153 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	LINC00614	P0C842	121 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	IGLC3	P0DOY3	106 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	CD33	P20138	364 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARF6	P62330	175 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NEDD4L-223	ENST00000588516	EBI3	Q14213	229 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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