RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HBBP68871 147 aa18.95■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EBI3Q14213 229 aa18.95■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C10orf105Q8TEF2 133 aa18.95■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TXN2Q99757 166 aa18.95■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPOCK3Q9BQ16 436 aa18.95■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q9H3A6 140 aa18.95■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA2Q9BZC7 2435 aa18.95■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BTX0 84 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDPQ00604 133 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLHDC1Q8N7A1 406 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR2D3Q8NGH3 330 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARPC1AQ92747 370 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLEC2AQ6UVW9 174 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF562Q6V9R5 426 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STPG4Q8N801 248 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa18.94■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYB5R2Q6BCY4 276 aa18.93■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF843Q8N446 348 aa18.93■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa18.93■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A8MWL6 223 aa18.93■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM106CPP0CH98 169 aa18.93■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BTF3P20290 206 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPATA12Q7Z6I5 190 aa18.93■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NRGNQ92686 78 aa18.93■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.92■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7EIM0 57 aa18.92■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPFFO15130 113 aa18.92■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 P01737 135 aa18.92■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLC1P0CG04 106 aa18.92■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFP30Q9Y2G7 519 aa18.92■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa18.91■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa18.91■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa18.91■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q56UQ5 140 aa18.91■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFB8O95169 186 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00614P0C842 121 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPOP30536 169 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PGLYRP4Q96LB8 373 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GFRA4Q9GZZ7 299 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPIPB6E9PJ23 425 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASL11BQ9BPW5 248 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIGD1AQ9Y241 93 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 S4R3C0 116 aa18.9■□□□□ 0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFS8O00217 210 aa18.89■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSG1P11464 419 aa18.89■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q8N9W7 124 aa18.89■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPG5Q9HCE0 2579 aa18.89■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LYZP61626 148 aa18.89■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q86TA4 180 aa18.89■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLEC5AQ9NY25 188 aa18.89■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV2-11P01706 119 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PAX8Q06710 450 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OTORQ9NRC9 128 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM14CQ9P0S9 112 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPIPB5A8MRT5 1133 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0QZ24 198 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLL1P15814 213 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q71RC1 249 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1RLQ9NZP8 487 aa18.88■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa18.87■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C20orf202A1L168 122 aa18.87■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A1L4Q6 167 aa18.87■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM208BQ5VWN6 2430 aa18.87■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV1-17P01599 117 aa18.86■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FANCD2OSQ96PS1 177 aa18.86■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM231BA6NCW3 169 aa18.86■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM162BQ5T6X4 162 aa18.86■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C16orf54Q6UWD8 224 aa18.86■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRXO43186 299 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APOHP02749 345 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC9CQ8N5M4 171 aa18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM70Q9BUB7 260 aa18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF785A8K8V0 405 aa18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRD3OSQ6XYD6 125 aa18.85■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRK2Q5S007 2527 aa18.84■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV40A0A0B4J280 105 aa18.84■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CELSR2Q9HCU4 2923 aa18.84■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR4F17Q8NGA8 305 aa18.84■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFHX3Q15911 3703 aa18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms