RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564131.1

RRN3-206, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 1,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-206ENST00000564131 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 C18orf15Q96N68 181 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.46□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 K7EPK0 472 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 HYPMO75409 117 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 HTN1P15515 57 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 HOXA5P20719 270 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 FGL1Q08830 312 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 IL18Q14116 193 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.45□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 FNDC10F2Z333 226 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 RLN2P04090 185 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 IL5P05113 134 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 XGP55808 180 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 LINC00315P59091 139 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 AKR1C1Q04828 323 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 UHRF2Q96PU4 802 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SOSTQ9BQB4 213 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 MCUBQ9NWR8 336 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 WRBO00258 174 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 ID3Q02535 119 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 LCN15Q6UWW0 184 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 CCDC190Q86UF4 302 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 ODF3Q96PU9 254 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 A0A096LPF7 62 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 A0A0J9YY99 117 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SNURFLB1AK76 121 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 EREGO14944 169 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 LINC00869P0C866 280 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 GAGE12BA1L429 117 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SIVA1O15304 175 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 GAGE7O76087 117 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SFT2D2O95562 160 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 OR5G3P0C626 314 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 GAGE12FP0CL80 117 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 GAGE12GP0CL81 117 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 GAGE12IP0CL82 117 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SMIM18P0DKX4 95 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 ERVFC1-1P60608 527 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 KIR3DS1Q14943 382 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 PATE2Q6UY27 113 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 NFE4Q86UQ8 179 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 FRZBQ92765 325 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 ARV1Q9H2C2 271 aa7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 H3BP45 60 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 K7EP13 123 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 VAMP1P23763 118 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 AP3S2P59780 193 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 DLK1P80370 383 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SPCS2Q15005 226 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 Q5VSD8 79 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 ARL6Q9H0F7 186 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3-206ENST00000564131 SMCO3A2RU48 225 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 TEPPQ6URK8 271 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 TRIM63Q969Q1 353 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 SMIM8Q96KF7 97 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3-206ENST00000564131 FABP12A6NFH5 140 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms