RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 BATFQ16520 125 aa13.65□□□□□ -0.22
MEIS3-211ENST00000561204 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.65□□□□□ -0.22
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
MEIS3-211ENST00000561204 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.65□□□□□ -0.22
MEIS3-211ENST00000561204 CRIP1P50238 77 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 Q8N6K4 173 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 K7EQM0 130 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.63□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 UCNP55089 124 aa13.63□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 ATRXP46100 2492 aa13.63□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 Q6ZN92 141 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 KLHDC1Q8N7A1 406 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 NDUFB8O95169 186 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV3-23P01764 117 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 TXN2Q99757 166 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 LPAR2Q9HBW0 351 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 C21orf62Q9NYP8 219 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 A0A1B0GUT8 65 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 LINC00614P0C842 121 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 PDE6HQ13956 83 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 C8orf49Q96NF6 230 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 A0A1W2PPR1 153 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 EBI3Q14213 229 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 DTX2Q86UW9 622 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF138P52744 262 aa13.6□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 OOSP1A8MZH6 123 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 S100A7AQ86SG5 101 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 C1RLQ9NZP8 487 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 OR2T8A6NH00 312 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 NDUFS7O75251 213 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 IGLL1P15814 213 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 RIGQ13278 110 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 MINOS1Q5TGZ0 78 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 GATD1Q8NB37 220 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-211ENST00000561204 CTSGP08311 255 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM11P17152 192 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 TFPI2P48307 235 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 SIRPDQ9H106 197 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 LEPROTL1O95214 131 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 TSPOP30536 169 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 THYN1Q9P016 225 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 C20orf202A1L168 122 aa13.57□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF124Q15973 351 aa13.57□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 STPG4Q8N801 248 aa13.57□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 WNK2Q9Y3S1 2297 aa13.57□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 CT45A10P0DMU9 189 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 PSG9Q00887 426 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 TPPP3Q9BW30 176 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 OR4C46A6NHA9 309 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 DLEU1O43261 78 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 CSN1S1P47710 185 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 Q8N9W7 124 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 TMUB1Q9BVT8 246 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 A0A1B0GW15 77 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 CSN3P07498 182 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 Q6AWC8 147 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 AJUBAQ96IF1 538 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.54□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.54□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 SH2D1AO60880 128 aa13.54□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 OR5AL1P0C617 328 aa13.54□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.54□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 IGHG4P01861 327 aa13.54□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 RABAC1Q9UI14 185 aa13.54□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 MED13LQ71F56 2210 aa13.53□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 SVEP1Q4LDE5 3571 aa13.53□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.53□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM189A5PLL7 270 aa13.53□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 GAGE1Q13065 139 aa13.53□□□□□ -0.24
MEIS3-211ENST00000561204 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms