RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 OR4K15Q8NH41 348 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 GRPEL2Q8TAA5 225 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CT55Q8WUE5 264 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 IMUPQ9GZP8 106 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 POPDC3Q9HBV1 291 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TVP23BQ9NYZ1 205 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 USE1Q9NZ43 259 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ARL5AQ9Y689 179 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 DOCK4Q8N1I0 1966 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.27□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HECW2Q9P2P5 1572 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CST8O60676 142 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 IGHV3-33P01772 117 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CALB1P05937 261 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PDE6GP18545 87 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 EVI2AP22794 236 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SULT1A1P50225 295 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RANP62826 216 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TMED1Q13445 227 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF56Q15929 161 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC122Q5T0U0 273 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PATE2Q6UY27 113 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC18Q8N456 261 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR5D16Q8NGK9 328 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SLC25A40Q8TBP6 338 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 STAG3L4Q8TBR4 150 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 BORCS7Q96B45 105 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MALSU1Q96EH3 234 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HYLS1Q96M11 299 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF714Q96N38 554 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 AP1S3Q96PC3 154 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 NPCDR1Q9BY65 106 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM126AQ9H061 195 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RNF122Q9H9V4 155 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ENY2Q9NPA8 101 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 VWFP04275 2813 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.28□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TGP01266 2768 aa-0.28□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 NUP98P52948 1817 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ATRQ13535 2644 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 RFX7Q2KHR2 1363 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 COL6A3P12111 3177 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TNXBP22105 4242 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0J9YY99 117 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 hADV38S2A0JD32 116 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 hDV103S1A0JD37 113 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 A6NN06 94 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 LYRM1O43325 122 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 GGCTO75223 188 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 IGHV3-30P01768 117 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TTRP02766 147 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 C8GP07360 202 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 HLA-EP13747 358 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 SRIP30626 198 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2BP63146 152 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 AESQ08117 197 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 OR2F1Q13607 317 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 RRN3P1Q2M238 152 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 IFT20Q8IY31 132 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 PTH2Q96A98 100 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 C8orf76Q96K31 380 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00208Q96KT6 92 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 LIMD2Q9BT23 127 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 UCK1Q9HA47 277 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 GLTPQ9NZD2 209 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 VPS29Q9UBQ0 182 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 KIF1BO60333 1816 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-0.29□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 COL24A1Q17RW2 1714 aa-0.3□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 RTL1A6NKG5 1358 aa-0.3□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ROBO3Q96MS0 1386 aa-0.3□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 MAP3K5Q99683 1374 aa-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms