RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 C19orf84I3L1E1 186 aa16.6■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 OVOL3O00110 214 aa16.6■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 EBLN2Q6P2I7 272 aa16.6■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa16.6■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 Q8N6K4 173 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 TPPP3Q9BW30 176 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 PKD1L2Q7Z442 2459 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 M0R2Z0 102 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 MFAP4P55083 255 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 SPATA12Q7Z6I5 190 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 C21orf62Q9NYP8 219 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 PSG8Q9UQ74 426 aa16.59■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa16.58■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa16.58■□□□□ 0.25
TMEM260-216ENST00000557657 NPIPB6E9PJ23 425 aa16.58■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 RAB4AP20338 218 aa16.58■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 MIEN1Q9BRT3 115 aa16.58■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 SIRPDQ9H106 197 aa16.58■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 LINC01548A6NM66 108 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 NPIPB5A8MRT5 1133 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 HLA-DMBP28068 263 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 SPATA45Q537H7 98 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00173Q6ZV60 143 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 BORCS7Q96B45 105 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 M0R143 59 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 ARMS2P0C7Q2 107 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 TTC9CQ8N5M4 171 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 AJUBAQ96IF1 538 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 BPESC1Q9GZL8 116 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 FLNCQ14315 2725 aa16.57■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 MUC21A0A140T8X8 626 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 FAM181BA6NEQ2 426 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 APOHP02749 345 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 BATFQ16520 125 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 MUC21Q5SSG8 566 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 C1RLQ9NZP8 487 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 PSG3Q16557 428 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 ECSCRQ19T08 205 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 CT83Q5H943 113 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 Q8N9W7 124 aa16.56■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.55■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 CTSGP08311 255 aa16.55■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 CTRLP40313 264 aa16.55■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.55■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 TMUB1Q9BVT8 246 aa16.55■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 CHEK1O14757 476 aa16.54■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM75Q8N9X5 138 aa16.54■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 CSN3P07498 182 aa16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 SAA4P35542 130 aa16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 Q8TAT8 98 aa16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 G3V318 75 aa16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.53■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 GPR183P32249 361 aa16.52■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 C16orf54Q6UWD8 224 aa16.52■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 GFRA4Q9GZZ7 299 aa16.52■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 TP73-AS1Q9UF72 201 aa16.52■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa16.52■□□□□ 0.24
TMEM260-216ENST00000557657 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 C2orf70A6NJV1 201 aa16.52■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 G0S2P27469 103 aa16.52■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.52■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 OR4B1Q8NGF8 309 aa16.52■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.51■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 GNLYP22749 145 aa16.51■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 EBI3Q14213 229 aa16.51■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.51■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa16.51■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 ATP6V0E1O15342 81 aa16.51■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 PIEZO1Q92508 2521 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 LMO4P61968 165 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 C15orf32Q32M92 178 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 MINOS1Q5TGZ0 78 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 TCAPO15273 167 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 AAMDCQ9H7C9 122 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 ZFP30Q9Y2G7 519 aa16.5■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM219Q86XT9 240 aa16.49■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 VGLL1Q99990 258 aa16.49■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00527Q9UJ94 153 aa16.49■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa16.49■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 K7EQM0 130 aa16.49■□□□□ 0.23
TMEM260-216ENST00000557657 HAX1O00165 279 aa16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms