RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 CSTL1Q9H114 145 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 ATOH7Q8N100 152 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 NPBQ8NG41 125 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 MYO7AQ13402 2215 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf63A6NC05 138 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 CDK2AP2O75956 126 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TDGF1P3P51864 188 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 CR1LQ2VPA4 569 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 REG4Q9BYZ8 158 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 LIME1Q9H400 295 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 A0A087WV48 116 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZR03 302 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 JPT2Q9H910 190 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 OVOL3O00110 214 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 PSCAO43653 123 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C20orf78Q9BR46 151 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 COLCA2A8K830 154 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 DAD1P61803 113 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 DKK4Q9UBT3 224 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf52Q96A22 123 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 CDKN1BP46527 198 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01545Q5VT33 79 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C14orf144Q96I85 54 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF134P52741 427 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 H3BQ85 93 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF479Q96JC4 524 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 CST9LQ9H4G1 147 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SYNJ2BPP57105 145 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SHISA9B4DS77 424 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB131AP59861 70 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 EVI2AP22794 236 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 EP400Q96L91 3159 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 DKK1O94907 266 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TAL2Q16559 108 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 VWC2Q2TAL6 325 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GV90 55 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TNFRSF6BO95407 300 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 RHOHQ15669 191 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 ZMAT4Q9H898 229 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 MMP23AO75900 390 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 LHBP01229 141 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1-16P04430 117 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 FSTL3O95633 263 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 H3BMM0 161 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 WDR86Q86TI4 376 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM243Q9BU79 118 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 NINQ8N4C6 2090 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 PMVKQ15126 192 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms