RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545882.5

CNN3-207, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-207ENST00000545882 NPBQ8NG41 125 aa12□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 C8orf49Q96NF6 230 aa12□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 RNF24Q9Y225 148 aa12□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 HILPDAQ9Y5L2 63 aa12□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 HTR1DP28221 377 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 RIGQ13278 110 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 FANCD2OSQ96PS1 177 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 COX11Q9Y6N1 276 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 F8W735 103 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 LY6HO94772 140 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 ARF6P62330 175 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 KLRD1Q13241 179 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 PET117Q6UWS5 81 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 DPM3Q9P2X0 92 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.99□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 TACC2O95359 2948 aa11.98□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.98□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.98□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 TPRP12270 2363 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.98□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa11.98□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.98□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 K7EQM0 130 aa11.97□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 MPV17L2Q567V2 206 aa11.97□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 LINC01545Q5VT33 79 aa11.97□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.96□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 ODF3BA8MYP8 253 aa11.96□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.96□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.96□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.96□□□□□ -0.49
CNN3-207ENST00000545882 A0A1B0GW15 77 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 GNG7O60262 68 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 FAM106CPP0CH98 169 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 NDPQ00604 133 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 ZNF738Q8NE65 137 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 ZNF747Q9BV97 191 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.96□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 ABCA4P78363 2273 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 A0A096LNJ9 63 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 A0A1W2PRD5 423 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 A0A1W2PRF3 423 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 A0A1W2PRM7 423 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 NCR2O95944 276 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 PTTG1IPP53801 180 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 UBE2V1Q13404 147 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 PDE6HQ13956 83 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 LRBAP50851 2863 aa11.95□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 H0Y8G0 127 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 MFAP4P55083 255 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 CDSNQ15517 529 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 TPPP3Q9BW30 176 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 TMEM213A2RRL7 107 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 SH2D1AO60880 128 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 UCNP55089 124 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 FOXE3Q13461 319 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 Q6AWC8 147 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 U3KQK5 164 aa11.94□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 NUDT3O95989 172 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 SFTPCP11686 197 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 HES1Q14469 280 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.93□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 M0R1W7 72 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 TAX1BP3O14907 124 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 IGHV3-23P01764 117 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 PRTN3P24158 256 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 CEACAM3P40198 252 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 ZNF575Q86XF7 245 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 ARPC1AQ92747 370 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 RAXQ9Y2V3 346 aa11.92□□□□□ -0.5
CNN3-207ENST00000545882 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms