RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 CFHR3Q02985 330 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 XP32Q5T750 250 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 BLNKQ8WV28 456 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 CCDC140Q96MF4 163 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 METTL26Q96S19 204 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 USP24Q9UPU5 2620 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.85□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PS18 150 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 A8MWP6 167 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 SNURFLB1AK76 121 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 SLC17A3O00476 420 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 CLEC3BP05452 202 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 CRISP2P16562 243 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 RAB4AP20338 218 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 BMI1P35226 326 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 FOXE3Q13461 319 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 ECSCRQ19T08 205 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 TMEM86BQ8N661 226 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 NUP35Q8NFH5 326 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 GPR61Q9BZJ8 451 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 PSG8Q9UQ74 426 aa5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PACS1-211ENST00000531298 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 OR2T8A6NH00 312 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 IGHG4P01861 327 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 AMBPP02760 352 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 RNF224P0DH78 156 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CT45A10P0DMU9 189 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 COL8A1P27658 744 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 HBBP68871 147 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 RNF152Q8N8N0 203 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 LINC00479Q96M42 142 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 NEU1Q99519 415 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ZZEF1O43149 2961 aa5.83□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 KALRNO60229 2985 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 HIGD1CA8MV81 97 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 G3V318 75 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 H3BUX3 64 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 TRGV3P03979 118 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GPR183P32249 361 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 IER3P46695 156 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 TPPP2P59282 170 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GNG5P63218 68 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PYY3Q5JQD4 70 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 LEMD1Q68G75 181 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GPHB5Q86YW7 130 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CNFNQ9BYD5 112 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.82□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 APCSP02743 223 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ELANEP08246 267 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PMCHP20382 165 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 HNF1AP20823 631 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CBLN1P23435 193 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 RIGQ13278 110 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 IQCJQ1A5X6 159 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 Q6YL49 198 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 Q8N2B8 174 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GLMPQ8WWB7 406 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PRR25Q96S07 402 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ASCL2Q99929 193 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 SPG11Q96JI7 2443 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.81□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 A0A1B0GUT8 65 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 A6NJY4 79 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms