RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 PRAC2D3DTV9 90 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 GABARAPH6UMI1 98 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 K7EP13 123 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM127O75204 238 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 B3GALNT1O75752 331 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 GABARAPO95166 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 FABP1P07148 127 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 CRYGDP07320 174 aa4.87□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 EVI2AP22794 236 aa4.87□□□□□ -1.63
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CLVS1-211ENST00000524095 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 GPR132Q9UNW8 380 aa4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CLVS1-211ENST00000524095 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-211ENST00000524095 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.83□□□□□ -1.64
CLVS1-211ENST00000524095 PITX3O75364 302 aa4.83□□□□□ -1.64
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