RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFRSF1A	P19438	455 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CNTFR	P26992	372 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	HTR1D	P28221	377 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CEACAM3	P40198	252 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL8	P80075	99 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM27E3	Q08E93	113 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6AWC8	147 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	PRNT	Q86SH4	94 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFRSF14	Q92956	283 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	DYSF	O75923	2080 aa		3.9	□□□□□ -1.78
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	C7orf71	A4D174	169 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf118	A6NHY6	69 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	LY6L	H3BQJ8	138 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BRM9	83 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EIM0	57 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EM74	188 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM106CP	P0CH98	169 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	LYZ	P61626	148 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PSG3	Q16557	428 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF151	Q2KHN1	245 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZS92	163 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FA2H	Q7L5A8	372 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF575	Q86XF7	245 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PRSS33	Q8NF86	280 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	C17orf77	Q96MU5	243 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NGB	Q9NPG2	151 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PSG8	Q9UQ74	426 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF24	Q9Y225	148 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CACNA1H	O95180	2353 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EP34	96 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SIVA1	O15304	175 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	KLK10	O43240	276 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RBP4	P02753	201 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CSN3	P07498	182 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CSN1S1	P47710	185 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	BSPH1	Q075Z2	132 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	HSD52	Q0P140	79 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE6H	Q13956	83 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PIFO	Q8TCI5	191 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF5	Q99942	180 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA25	Q9BR10	227 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	JKAMP	Q9P055	326 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RABAC1	Q9UI14	185 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0G2JNJ9	132 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE12B	A1L429	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM213	A2RRL7	107 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	VSTM5	A8MXK1	200 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SHISA9	B4DS77	424 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		D6R8Y8	96 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	C16orf97	H3BN30	126 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		3.88	□□□□□ -1.79

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