RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 STAG3L3P0CL85 134 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 RAB14P61106 215 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 MORN5Q5VZ52 161 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 LEMD1Q68G75 181 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 GLMPQ8WWB7 406 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 PAXXQ9BUH6 204 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 OR51M1Q9H341 326 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF785A8K8V0 405 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 A8MZ25 164 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 HBE1P02100 147 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 FHITP49789 147 aa8.5□□□□□ -1.05
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UBE2B-208ENST00000511807 PAFAH1B2P68402 229 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF726P1Q15940 193 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 LCN15Q6UWW0 184 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 TCF24Q7RTU0 167 aa8.5□□□□□ -1.05
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UBE2B-208ENST00000511807 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 TUBA4BQ9H853 241 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 EDN2P20800 178 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 IFITM2Q01629 132 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 GUK1Q16774 197 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 HAGHQ16775 308 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 LCN12Q6JVE5 192 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA25Q9BR10 227 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 MLXQ9UH92 298 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 GCHFRP30047 84 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 PSMB3P49720 205 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 PPT1P50897 306 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.48□□□□□ -1.05
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UBE2B-208ENST00000511807 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 HRH4Q9H3N8 390 aa8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 TENM2Q9NT68 2774 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 A0A087X0K7 114 aa8.47□□□□□ -1.05
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UBE2B-208ENST00000511807 OR10J4P0C629 311 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 PYYP10082 97 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SSX7Q7RTT5 188 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 NRN1Q9NPD7 142 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 SORL1Q92673 2214 aa8.46□□□□□ -1.05
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF253O75346 499 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 IGLC2P0DOY2 106 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 ID1P41134 155 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 PSG9Q00887 426 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 PDE6HQ13956 83 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.46□□□□□ -1.06
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UBE2B-208ENST00000511807 FXYD5Q96DB9 178 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF503Q96F45 646 aa8.46□□□□□ -1.06
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UBE2B-208ENST00000511807 RETNQ9HD89 108 aa8.46□□□□□ -1.06
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UBE2B-208ENST00000511807 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GV50 99 aa8.45□□□□□ -1.06
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UBE2B-208ENST00000511807 H3BQ15 152 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 RGS13O14921 159 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 IFNA1P01562 189 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 CD81P60033 236 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 GUCA2BQ16661 112 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-208ENST00000511807 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.45□□□□□ -1.06
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