RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 C4orf3Q8WVX3 66 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 RAB37Q96AX2 223 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 ISOC1Q96CN7 298 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 TP53RKQ96S44 253 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 EFCAB11Q9BUY7 163 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 OR2H1Q9GZK4 316 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 OTORQ9NRC9 128 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 NDUFAF1Q9Y375 327 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 ASB4Q9Y574 426 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 U3KQ87 197 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 NUP210LQ5VU65 1888 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa0.6□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 TNS3Q68CZ2 1445 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 TRAV10A0A0B4J240 114 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 PRORSD1PA6NEY8 169 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 OR2T8A6NH00 312 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 GABARAPH6UMI1 98 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 H7BYZ3 331 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 FAM107AO95990 144 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 CD2P06729 351 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 BCL2P10415 239 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 FABP2P12104 132 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 S100A11P31949 105 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 CDK6Q00534 326 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM128Q5BJH2 165 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 FAM74A1Q5RGS3 127 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 C1orf134Q5TEV5 83 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 SAMD13Q5VXD3 122 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 C2orf82Q6UX34 121 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 TOMM20LQ6UXN7 152 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 AKAP14Q86UN6 197 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 ANGPTL5Q86XS5 388 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 THEM6Q8WUY1 208 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 MUCL1Q96DR8 90 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 HYLS1Q96M11 299 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 LRTM1Q9HBL6 345 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 TAS2R7Q9NYW3 318 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 NAT8BQ9UHF3 227 aa0.59□□□□□ -2.31
UBE2B-202ENST00000499038 MYOFQ9NZM1 2061 aa0.59□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 MED12LQ86YW9 2145 aa0.59□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 ALPK2Q86TB3 2170 aa0.59□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 PIK3C2AO00443 1686 aa0.59□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 NISCHQ9Y2I1 1504 aa0.59□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 RTL9Q8NET4 1388 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 MYH10P35580 1976 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 A0A087WSZ3 146 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 TRAV27A0A087WT01 109 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 hDV103S1A0JD37 113 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 TSTD3H0UI37 97 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 M0R2N4 97 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 CCL16O15467 120 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 LYRM1O43325 122 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 ERC2-IT1O76042 136 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 MT-ND6P03923 174 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 NBEAP1P0C6P0 100 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 CXCL8P10145 99 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 RPL7P18124 248 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 SDC2P34741 201 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 MPV17LQ2QL34 196 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 HRCT1Q6UXD1 115 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 ARPINQ7Z6K5 226 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 LRRC18Q8N456 261 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 FAM216BQ8N7L0 139 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 PATE1Q8WXA2 126 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 BORCS5Q969J3 196 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 MCEEQ96PE7 176 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 GGACTQ9BVM4 153 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 ORMDL1Q9P0S3 153 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 ZFP30Q9Y2G7 519 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 MED31Q9Y3C7 131 aa0.58□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa0.57□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 LAMB4A4D0S4 1761 aa0.57□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 EML6Q6ZMW3 1958 aa0.57□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 BCL9O00512 1426 aa0.57□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
UBE2B-202ENST00000499038 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms