RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 NCOA1Q15788 1441 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.57□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 APC2O95996 2303 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 SERPINB9P50453 376 aa-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.58□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 ERBINQ96RT1 1412 aa-0.58□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 NCOR1O75376 2440 aa-0.58□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.59□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.59□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-0.59□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.59□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 MYH7BA7E2Y1 1941 aa-0.59□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa-0.59□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 ARPINQ7Z6K5 226 aa-0.59□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 ANGPTL5Q86XS5 388 aa-0.59□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 IMUPQ9GZP8 106 aa-0.59□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 GLTPQ9NZD2 209 aa-0.59□□□□□ -2.5
SENP6-210ENST00000487548 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
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SENP6-210ENST00000487548 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.6□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 MIA2Q96PC5 1412 aa-0.6□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 TRAV27A0A087WT01 109 aa-0.6□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 ODAMA1E959 279 aa-0.6□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 FREM3P0C091 2139 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 LIMD2Q9BT23 127 aa-0.6□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 TGP01266 2768 aa-0.6□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.61□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 M0R036 132 aa-0.61□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 BCL2L15Q5TBC7 163 aa-0.61□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 RTL1A6NKG5 1358 aa-0.61□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 TAX1BP3O14907 124 aa-0.62□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 S100A7AQ86SG5 101 aa-0.62□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 C10orf111Q8N326 155 aa-0.62□□□□□ -2.51
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SENP6-210ENST00000487548 LPAR5Q9H1C0 372 aa-0.62□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa-0.62□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 CACNA1HO95180 2353 aa-0.62□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 PKHD1P08F94 4074 aa-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 COL24A1Q17RW2 1714 aa-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 A0A0J9YY99 117 aa-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 C9orf170A2RU37 121 aa-0.63□□□□□ -2.51
SENP6-210ENST00000487548 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-0.63□□□□□ -2.51
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