RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF14Q15058 1648 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087WSZ3 146 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A0J9YY10 115 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GX78 115 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MKRN2OSH3BPM6 223 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DRAP01903 254 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ORM1P02763 201 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MGST1P10620 155 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BOP23527 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BBP33778 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BDP58876 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BCP62807 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 FABP9Q0Z7S8 132 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 GUK1Q16774 197 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST2H2BEQ16778 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNAL1Q4LDG9 190 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BHQ93079 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 OPTNQ96CV9 577 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYTH2Q99418 400 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BNQ99877 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2BMQ99879 126 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 C14orf105Q9NVL8 296 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TIAM1Q13009 1591 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PBRM1Q86U86 1689 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-0.88□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ECM29Q5VYK3 1845 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM213A2RRL7 107 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 YPEL1O60688 119 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAP1O75689 374 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DHFRP00374 187 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 IVLP07476 585 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL3P08700 152 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 KDELR2P33947 212 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 KHDC3LQ587J8 217 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6Q795 121 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 COPS6Q7L5N1 327 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 IQCF2Q8IXL9 164 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB125Q8N687 156 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR13D1Q8NGV5 346 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DHRS9Q9BPW9 319 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DERL2Q9GZP9 239 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR51I2Q9H344 312 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSTPIP2Q9H939 334 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 PROK2Q9HC23 129 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 C14orf132Q9NPU4 83 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP14Q9NWM8 211 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLR1DQ9Y2S0 133 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF11Q9Y3C5 154 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-0.89□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP10BO94823 1461 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUPR2A6NF83 97 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 F5H768 121 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD3DP04234 171 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCN1P31025 176 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 INSL4Q14641 139 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 BATFQ16520 125 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ESRGQ1W209 222 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01554Q52M75 96 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA45Q537H7 98 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANGPTL5Q86XS5 388 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD302Q8IX05 232 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNBD2Q96M20 576 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCOA1Q15788 1441 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.9□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 UNC13BO14795 1591 aa-0.91□□□□□ -2.55
CACNA2D1-211ENST00000486539 C4AP0C0L4 1744 aa-0.91□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms