RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476050.5

TRAF3IP3-211, Transcript of TRAF3 interacting protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF3IP3, Length 3,302 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3-211ENST00000476050 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.15□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.15□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 AP4M1O00189 453 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 ARL3P36405 182 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 IER3P46695 156 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 PRR31Q5SQ13 230 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 ZNF785A8K8V0 405 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 M0QZK8 103 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 IGF1P05019 195 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 S100A7AQ86SG5 101 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 IMMP2LQ96T52 175 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 CBLN1P23435 193 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 FOXL1Q12952 345 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 NUDT11Q96G61 164 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.14□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 GPR82Q96P67 336 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 FAM223BA6NKX1 122 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 RNF182Q8N6D2 247 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 FMC1Q96HJ9 113 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 OSTCQ9NRP0 149 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 RAB4BP61018 213 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 ACANP16112 2415 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 Q86TA4 180 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 METTL26Q96S19 204 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 RNF24Q9Y225 148 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 PHOX2AO14813 284 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 LTAP01374 205 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 IGLV2-11P01706 119 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 RAB9AP51151 201 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 DIRC3C9JPN6 131 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 UBE2CO00762 179 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 BUB3O43684 328 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 BTF3L4Q96K17 158 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 GZMBP10144 247 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 CSN1S1P47710 185 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 TCF24Q7RTU0 167 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 Q8TAT8 98 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 PSG8Q9UQ74 426 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 NF1P21359 2839 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 A0A1B0GUS0 222 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 XKRY2A2RUG3 117 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 K7EQM0 130 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 SSTP61278 116 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 Q6YL49 198 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 C8orf49Q96NF6 230 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 SNURFLB1AK76 121 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 TYMSP04818 313 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 KLK9Q2XQG4 91 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 MBD6Q96DN6 1003 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 MLST8Q9BVC4 326 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 CHEK1O14757 476 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 FSHBP01225 129 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 P01737 135 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 EDN2P20800 178 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 PSG9Q00887 426 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 ERCC8Q13216 396 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 PSG3Q16557 428 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.1□□□□□ -1.27
TRAF3IP3-211ENST00000476050 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms