RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462996.1

PTPN18-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, human

TSL 4

Gene PTPN18, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN18-208	ENST00000462996	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996		Q9H521	79 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996		A0A087X0K7	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	S100A7	P31151	101 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	PITX3	O75364	302 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	AKR1C4	P17516	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	VBP1	P61758	197 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	DISC1	C4P0D8	188 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPN18-208	ENST00000462996	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996		J3KRW8	73 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	RAP2B	P61225	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	PAX4	O43316	350 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	HYPM	O75409	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	OR5G3	P0C626	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	IL5	P05113	134 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	PLP1	P60201	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	PRRT1	Q99946	306 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	LINC00869	P0C866	280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	WRB	O00258	174 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPN18-208	ENST00000462996	MED6	O75586	246 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	IGHV3-53	P01767	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	CXCL2	P19875	107 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SRPX	P78539	464 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	PRO0255	Q9UI72	69 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996		K7EP13	123 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SLC17A3	O00476	420 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SYNGR2	O43760	224 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SPINK4	O60575	86 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	PRAF2	O60831	178 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	CRYBA4	P53673	196 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPN18-208	ENST00000462996	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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