RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 WFDC1Q9HC57 220 aa9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 H3BP45 60 aa9.59□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 CST7O76096 145 aa9.59□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 MIFP14174 115 aa9.59□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 CLINT1Q14677 625 aa9.59□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.59□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.59□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 HRH4Q9H3N8 390 aa9.59□□□□□ -0.87
C9orf3-210ENST00000462125 X6R8D5 127 aa9.59□□□□□ -0.87
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C9orf3-210ENST00000462125 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 HLA-DRB4P13762 266 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ID1P41134 155 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 CAMLGP49069 296 aa9.58□□□□□ -0.88
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C9orf3-210ENST00000462125 RAB2AP61019 212 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.58□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF98A6NK75 572 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 FNDC10F2Z333 226 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ISLRO14498 428 aa9.57□□□□□ -0.88
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C9orf3-210ENST00000462125 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ATP6V0CP27449 155 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZRG5 221 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 C17orf77Q96MU5 243 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 GGACTQ9BVM4 153 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 HBE1P02100 147 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ORM2P19652 201 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 S100A7P31151 101 aa9.56□□□□□ -0.88
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C9orf3-210ENST00000462125 PLP1P60201 277 aa9.56□□□□□ -0.88
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C9orf3-210ENST00000462125 SERF2P84101 59 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 AKR1C1Q04828 323 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00052Q96N35 136 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 HERC2O95714 4834 aa9.56□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 GALR1P47211 349 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SELENOTP62341 195 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 GPR82Q96P67 336 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 XCL2Q9UBD3 114 aa9.55□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 MPDU1O75352 247 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 LY6G6CO95867 125 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 MBP02144 154 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 DEFB1P60022 68 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 VWC2Q2TAL6 325 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 NEU1Q99519 415 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 RSG1Q9BU20 258 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 C11orf94C9JXX5 98 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 H3BRN7 92 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 HYPMO75409 117 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 TCTAP57738 103 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ARL16Q0P5N6 197 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF709Q8N972 641 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 C16orf92Q96LL3 132 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 C20orf173Q96LM9 149 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-210ENST00000462125 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.53□□□□□ -0.88
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