RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 PINLYPA6NC86 204 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 D6R8Y8 96 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 NTF4P34130 210 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 ERCC8Q13216 396 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 COX11Q9Y6N1 276 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV2-5P01817 119 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0U1RRA0 63 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 THBDP07204 575 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 PRTN3P24158 256 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 KIR3DS1Q14943 382 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00479Q96M42 142 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SPANXCQ9NY87 97 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM126AQ9H061 195 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SOCS3O14543 225 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 RHODO00212 210 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 USMG5Q96IX5 58 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00473A8K010 186 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 CD5LO43866 347 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 RNF114Q9Y508 228 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C15orf62A8K5M9 175 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 E9PLN8 166 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SAP30O75446 220 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 MLANAQ16655 118 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF524Q96C55 264 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GWJ7 208 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TCRAP04437 139 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 STPG4Q8N801 248 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TRGV9Q99603 122 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TIMM23O14925 209 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 PSG3Q16557 428 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 UBL5Q9BZL1 73 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IL18BPO95998 194 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2WQ96B02 151 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf159Q96HA4 380 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 Q0VFX4 171 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IGLC2P0DOY2 106 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IGLC3P0DOY3 106 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZWC4 215 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 RMI2Q96E14 147 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 SMKR1H3BMG3 65 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 WISP1O95388 367 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LYNX1P0DP58 116 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 FAM231BA6NCW3 169 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 EFNA4P52798 201 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 Q0VG73 95 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 PMVKQ15126 192 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 UTF1Q5T230 341 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-202ENST00000400053 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.23□□□□□ -1.25
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