RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 ABCA1O95477 2261 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 M0R3E3 92 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 RABAC1Q9UI14 185 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 RNF114Q9Y508 228 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 NCOR2Q9Y618 2525 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 PSG9Q00887 426 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 ECSCRQ19T08 205 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 FAM19A2Q8N3H0 131 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 NPFFO15130 113 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 ATP6V0E1O15342 81 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 HSBP1O75506 76 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 NTF3P20783 257 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 CSN1S1P47710 185 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 ZNF785A8K8V0 405 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 IGHV4-39P01824 125 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 S100A7P31151 101 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 C15orf32Q32M92 178 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 NIT1Q86X76 327 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 BORCS7Q96B45 105 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 VAMP8Q9BV40 100 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 CHEK1O14757 476 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 TDRG1Q3Y452 100 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 ASCL2Q99929 193 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 HAX1O00165 279 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 CT45A10P0DMU9 189 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 GPR183P32249 361 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 KLK9Q2XQG4 91 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 Q8N976 141 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 ZNF502Q8TBZ5 544 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 PAM16Q9Y3D7 125 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 APOHP02749 345 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 RHOGP84095 191 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 PRR31Q5SQ13 230 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 C2orf88Q9BSF0 95 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 M0R2Z0 102 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 C3orf79P0CE67 100 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 CRIP1P50238 77 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GUT8 65 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 SSTP61278 116 aa10.77□□□□□ -0.68
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 CLEC3BP05452 202 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 Q6AWC8 147 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 C8orf49Q96NF6 230 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 VPS13CQ709C8 3753 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 PAX8Q06710 450 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 G3V318 75 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 RAB9AP51151 201 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 RIGQ13278 110 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GV90 55 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 A0A1B0GW15 77 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 LINC01548A6NM66 108 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 GOSR1O95249 250 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 CCL19Q99731 98 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 EREGO14944 169 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 CCDC140Q96MF4 163 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 MOB4Q9Y3A3 225 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 M0R143 59 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 CLEC19AQ6UXS0 136 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 TMEM219Q86XT9 240 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 PRR25Q96S07 402 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-202ENST00000398743 TPPP3Q9BW30 176 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 753.5 ms