RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 INSP01308 110 aa13.18□□□□□ -0.3
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SH3BP4-201ENST00000344528 NIT1Q86X76 327 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SH2D1AO60880 128 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 NOTCH2Q04721 2471 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ZGRF1Q86YA3 2104 aa13.17□□□□□ -0.3
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SH3BP4-201ENST00000344528 CR1LQ2VPA4 569 aa13.17□□□□□ -0.3
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SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087WX48 190 aa13.16□□□□□ -0.3
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SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.15□□□□□ -0.3
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SH3BP4-201ENST00000344528 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.15□□□□□ -0.3
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF876PQ49A33 203 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.14□□□□□ -0.31
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SH3BP4-201ENST00000344528 HELZP42694 1942 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MYLKQ15746 1914 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 D6R8Y8 96 aa13.14□□□□□ -0.31
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SH3BP4-201ENST00000344528 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 Q86TA4 180 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP4-201ENST00000344528 COLCA2A8K830 154 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP4-201ENST00000344528 NUP35Q8NFH5 326 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 VCYO14598 125 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 VGLL1Q99990 258 aa13.12□□□□□ -0.31
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SH3BP4-201ENST00000344528 LINC01619G3V211 115 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SHISA9B4DS77 424 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 K7EM74 188 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 Q8NFD4 153 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 LIME1Q9H400 295 aa13.1□□□□□ -0.31
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SH3BP4-201ENST00000344528 FXYD7P58549 80 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP23AO75900 390 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC11AP67812 179 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 REG4Q9BYZ8 158 aa13.1□□□□□ -0.31
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SH3BP4-201ENST00000344528 PAX9P55771 341 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
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SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM90A2PQ658T7 463 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF815PA8K554 130 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf30Q96GV9 206 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SPG11Q96JI7 2443 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFA4O00483 81 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF134P52741 427 aa13.08□□□□□ -0.32
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