RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01619G3V211 115 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM242Q9NWH2 141 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM256Q8N2U0 113 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 MS4A6AQ9H2W1 248 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 FREM3P0C091 2139 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 SBF1O95248 1867 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 SPINK13Q1W4C9 94 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 FAM90A2PQ658T7 463 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 F5H768 121 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 G3V318 75 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 Q86TA4 180 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZRM9 215 aa18.07■□□□□ 0.48
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PTPRM-201ENST00000332175 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
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PTPRM-201ENST00000332175 GAGE5Q13069 117 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRM-201ENST00000332175 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa18.07■□□□□ 0.48
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PTPRM-201ENST00000332175 C3orf79P0CE67 100 aa18■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 FER1L5A0AVI2 2057 aa18■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01559Q495D7 138 aa18■□□□□ 0.47
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM190Q8WZ59 177 aa17.99■□□□□ 0.47
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PTPRM-201ENST00000332175 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa17.97■□□□□ 0.47
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PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZS49 121 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 THSD7BQ9C0I4 1608 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 FAM120AOSQ5T036 256 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 A0A096LPF7 62 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 WISP1O95388 367 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM75Q8N9X5 138 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRM-201ENST00000332175 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
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