RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 TXN2Q99757 166 aa10.77□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 S4R3C0 116 aa10.77□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa10.77□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 EBLN2Q6P2I7 272 aa10.77□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 NDUFS7O75251 213 aa10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 CTSGP08311 255 aa10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 C1RLQ9NZP8 487 aa10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 CRXO43186 299 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 HSBP1O75506 76 aa10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM11P17152 192 aa10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 UBE2E1P51965 193 aa10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.76□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 K7EQM0 130 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 M0QZK8 103 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 BORCS7Q96B45 105 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 THYN1Q9P016 225 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ZFHX3Q15911 3703 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ATRXP46100 2492 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 M0R3E3 92 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 EFNA4P52798 201 aa10.75□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 TOX4O94842 621 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 NTF3P20783 257 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 PRORYQ9H606 182 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 M0R2Z0 102 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 LMO4P61968 165 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 PSG9Q00887 426 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA45Q537H7 98 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 Q56UQ5 140 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 CYB5R2Q6BCY4 276 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 IGHG4P01861 327 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 IGLC3P0DOY3 106 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 PMCHL1Q16048 86 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 Q6AWC8 147 aa10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1B0GW15 77 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 BTF3P20290 206 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF502Q8TBZ5 544 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 C8orf49Q96NF6 230 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ABCA2Q9BZC7 2435 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1B0GUT8 65 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 PRR31Q5SQ13 230 aa10.73□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 SPTA1P02549 2419 aa10.72□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 OR2T8A6NH00 312 aa10.72□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 FAM106CPP0CH98 169 aa10.72□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 AAMDCQ9H7C9 122 aa10.72□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.72□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ASCL2Q99929 193 aa10.72□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.72□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ITPR1Q14643 2758 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 A0A087X0K7 114 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 CHEK1O14757 476 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 IGHV3-23P01764 117 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 LCN12Q6JVE5 192 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF575Q86XF7 245 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 UQCR10Q9UDW1 63 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 RABAC1Q9UI14 185 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4C-201ENST00000317868 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 M0QZ24 198 aa10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 LINC00614P0C842 121 aa10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 SFTPCP11686 197 aa10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 SAA4P35542 130 aa10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 RIGQ13278 110 aa10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 LY6DQ14210 128 aa10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.71□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 WNK2Q9Y3S1 2297 aa10.7□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 C20orf202A1L168 122 aa10.7□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 C19orf84I3L1E1 186 aa10.7□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 ATP6V0E1O15342 81 aa10.7□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 SCGB2A1O75556 95 aa10.7□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.7□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 PRR25Q96S07 402 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM70Q9BUB7 260 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 SH2D1AO60880 128 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 MAJINQ3KP22 176 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC140Q96MF4 163 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 U3KQK5 164 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4C-201ENST00000317868 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms