RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 CSN3P07498 182 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 FABP2P12104 132 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 ORM2P19652 201 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 GLRXP35754 106 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 FAM201AQ5SY85 155 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.84□□□□□ -1.15
HCG18-242ENST00000602319 FRYLO94915 3013 aa7.84□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CACNG7P62955 275 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TM2D2Q9BX73 214 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 ZNF883P0CG24 379 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 COL6A3P12111 3177 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 D6R8Y8 96 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 K7EM74 188 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 NKX2-8O15522 239 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 NHLH1Q02575 133 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 PRNTQ86SH4 94 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 PCP2Q8IVA1 136 aa7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 E9PLD3 99 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 DNAJC13O75165 2243 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 NDUFS7O75251 213 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SMIM13P0DJ93 91 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 LINC01559Q495D7 138 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 H3BRN7 92 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-46P01743 117 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 DLX6P56179 175 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 ORMDL3Q8N138 153 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CCL13Q99616 98 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 VGLL1Q99990 258 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CACNA1GO43497 2377 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TNCP24821 2201 aa7.82□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-48P01763 117 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 AZU1P20160 251 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 EVI2AP22794 236 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 PRELID3AQ96N28 172 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 PSG8Q9UQ74 426 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 BMI1P35226 326 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 FXYD2P54710 66 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 ZNF575Q86XF7 245 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TEX22C9J3V5 150 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 F8W1H4 67 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SIGMAR1Q99720 223 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 LINC01619G3V211 115 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 I3L2K1 104 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SPRY3O43610 288 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CEACAM4O75871 244 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 ODF1Q14990 250 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 FRYQ5TBA9 3013 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TAL2Q16559 108 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CNFNQ9BYD5 112 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 NGBQ9NPG2 151 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 PRO0461Q9UI25 63 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TNFRSF1AP19438 455 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 MC5RP33032 325 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 DKK2Q9UBU2 259 aa7.8□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 MED13Q9UHV7 2174 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms